LabDAO mapuje budúcnosť umelej inteligencie s otvoreným zdrojom pre objavovanie liekov

Projekt Folding@home sa dostal na titulky počas pandémie COVID-19, aby využil nevyužitý výpočtový výkon na preskúmanie priestoru na vyhľadávanie skladania bielkovín na boj proti novému koronavírusu. Iniciatíva umožnila občanom stať sa vedcami vo svojom vlastnom práve a spustila rozsiahle simulácie rôznych molekulárnych konfigurácií proteínov v distribuovanej sieti „zapísaných“ počítačov po celom svete.

Táto decentralizovaná paradigma bola vyhlásená za to, že spája ľudí okolo spoločného problému a efektívne získava výpočtový výkon z davu, ale čo ak by sa výpočtový výkon a infraštruktúra na riešenie problémov obrátili? Inými slovami, čo keby jednotlivci mohli prevádzkovať svoje vlastné projekty využitím akumulovaného výpočtového výkonu a nástroje pre biologické experimenty na spustenie?

LabDAO robí tento sen skutočnosťou so svojou platformou PLEX. PLEX je open source nástroj príkazového riadka navrhnutý tak, aby sprístupnil nielen výpočtové zdroje, ale aj rôzne nástroje biologického strojového učenia (vytvorené ako balík „BioML“ v rámci LabDAO) na rôznych prostrediach. Či už experimentujete s dokovaním malých molekúl alebo s vlastnými simuláciami skladania proteínov, PLEX umožňuje používateľom preniknúť do knižnice nástrojov LabDAO, zdieľať výsledky a vizualizovať ich za menej ako päť minút.

Táto sada nástrojov a jej platforma umožňujúca používanie bola predstavená na Zuzalu's Blockchain Meets Biology summite začiatkom apríla, kde členka základného tímu LabDAO Lily Hansen-Gillis predviedla od začiatku do konca simuláciu vnútornej molekulárnej dynamiky. proteín nájsť svoju najstabilnejšiu konfiguráciu. Potom, ako samozvaný „nekodér“, previedla publikum od začiatku do konca – všetko s počítačom, WiFi, PLEX na príkazovom riadku a nič viac.

V širšom zmysle je LabDAO decentralizovaná platforma s podporou webu3 (súčasť väčšieho hnutia „DeSci“), ktorá sa zaviazala vytvoriť produktívnejšie prostredie na objavovanie liekov s otvoreným zdrojom. Sprístupnením špičkových nástrojov a zdrojov širšiemu ekosystému sa LabDAO snaží vytvoriť správne prostredie pre transparentný a dostupný vedecký pokrok. Či už odstránením potreby mať výskumníkov vlastný hardvér alebo výpočtovú infraštruktúru alebo publikovaním výsledkov experimentov na blockchainovej knihe tak, aby boli ovládateľné a reprodukovateľné, organizácia sa zaviazala umožniť viac inovácií prostredníctvom spolupráce – odstraňovať bariéry spôsobené chudobou. použiteľnosť a siloed, špecializované špeciality.

Úsilie LabDAO vybudovať tento svet DeSci budúcnosti pre dnešok nedávno dostalo podporu vo forme kola financovania 3.6 milióna dolárov od rôznych iných DAO, Inflection.xyz, Balaji Srinivasan a ďalších. Tento prílev podpory prispeje k pokračujúcemu úsiliu vybudovať softvérové ​​nástroje s otvoreným zdrojovým kódom a posilniť výskumný ekosystém LabDAO.

Čo sa týka samotného PLEX, medzi bezprostredné ďalšie kroky na obzore patrí testovanie platformy v rôznych vedeckých spoluprácach, kontajnerovanie rôznych nástrojov a zhromažďovanie potrebného hardvéru na podporu siete BioML.

Čo sa týka dlhodobého hľadiska, možno ďalší liek na záchranu života počas ďalšieho veľkého prepuknutia infekčnej choroby bude navrhnutý s využitím sily PLEX, jeden decentralizovaný krok vpred za druhým. Ako sa ekosystém neustále rozrastá, ukáže to len čas.

Ďakujem Aishani Aatresh pre ďalší výskum a správy o tomto článku. Som zakladateľom SynBioBeta a niektoré spoločnosti, o ktorých píšem, sú sponzormi Konferencia SynBioBeta. Ak chcete získať ďalší obsah, môžete sa prihlásiť na odber môj týždenný newsletter.